La IA se utiliza para diseñar nuevos genomas de bacteriófagos en el laboratorio.

Un equipo de investigadores en Estados Unidos ha utilizado la inteligencia artificial (IA) para diseñar genomas completos de nuevos bacteriófagos, lo que supone el primer esfuerzo de este tipo del que se tiene constancia y un paso hacia posibles terapias con fagos diseñadas mediante IA, según un estudio publicado el jueves en la revista Science.

Bajo la dirección del investigador principal y autor correspondiente, Brian Hie, profesor asistente en la Universidad de Stanford e investigador de innovación en el Instituto Arc, los investigadores utilizaron dos modelos de lenguaje genómico, Evo 1 y Evo 2, para generar genomas de fagos completos con arquitecturas genéticas realistas y especificidad para un huésped bacteriano, Escherichia coli C. (E. coli).

Según los investigadores, este fue el primer diseño generativo de genomas completos de bacteriófagos. Los bacteriófagos, también llamados fagos, son virus que infectan bacterias en lugar de personas, animales o plantas. Según el estudio, los investigadores generaron y filtraron miles de secuencias candidatas antes de seleccionar cerca de 300 diseños. Según el estudio, de esos diseños, 285 se sintetizaron y ensamblaron con éxito en células de E. coli, y 16 produjeron bacteriófagos viables que se reprodujeron y mataron bacterias en pruebas de laboratorio.

Algunos de los fagos diseñados superaron al fago natural phiX174, que infecta a E. coli, en la eliminación de bacterias en pruebas de laboratorio directas. Una mezcla de los fagos diseñados también resultó eficaz contra cepas de E. coli que se habían vuelto resistentes a phiX174, lo que, según los autores, apunta a posibles terapias con fagos diseñadas mediante inteligencia artificial.

En un artículo de opinión adjunto, Thomas Inglesby y Moritz Hanke, de la Universidad Johns Hopkins, señalaron que este avance suscitaba inquietudes en materia de bioseguridad. Solicitaron que se exigiera legalmente el análisis de secuencias potencialmente peligrosas en los pedidos de material genético sintético, en lugar de depender de medidas de seguridad voluntarias.

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